La Hermandad del Museo, de origen gremial, fue creada por los plateros de la ciudad de San Andrés en 1575. Tan sólo dos años después pasa al Convento de la Merced, actual Museo de Bellas Artes. La Virgen de las Aguas formaba misterio con el cristo hasta la Semana Santa de 1922, cuando aconteció la primera salida bajo palio de esta Dolorosa.
El Museo fue la primera cofradía en salir un Lunes Santo, lo que ocurrió en 1923. Anteriormente cumplía la estación de penitencia los Viernes Santos.
La hermandad ha celebrado recientemente el 450 aniversario fundacional, culminando con una memorable procesión extraordinaria recreando el Stabat Mater en el paso del crucificado. Se continúa interviniendo en la restauración del paso de palio de la Virgen, concretamente en las bambalinas.
| CRUZ DE GUÍA | PALIO | |
| 20:30 | Salida (20:35) | |
| 21:00 | Pl. Museo | Salida (21:15) |
| 21:30 | Alfonso XII | Pl. Museo |
| 22:00 | Campana (22:09) | Alfonso XII |
| 22:30 | Plaza (22:49) | Campana (22:50) |
| 23:00 | P. San Miguel (23:15) | Plaza (23:30) |
| 23:30 | P. Palos (23:34) | P. San Miguel (23:56) |
| 00:00 | García de Vinuesa | P. Palos (0:15) |
| 00:30 | Castelar | Alemanes |
| 01:00 | Pl. Molviedro | Castelar |
| 01:30 | Zaragoza | Pl. Molviedro |
| 02:00 | Gravina | Zaragoza |
| 02:30 | Entrada | Gravina |
| 03:00 | Entrada (3:15) |
